Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Etv4P28322 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Etv4P28322 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Etv4P28322 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Etv4P28322 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Etv4P28322 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Etv4P28322 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Etv4P28322 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Etv4P28322 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Etv4P28322 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms