Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms