Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afxP27661 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms