Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LynP25911 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LynP25911 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LynP25911 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LynP25911 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LynP25911 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LynP25911 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LynP25911 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LynP25911 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LynP25911 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LynP25911 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LynP25911 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LynP25911 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LynP25911 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LynP25911 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LynP25911 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms