Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja1P23242 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja1P23242 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja1P23242 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja1P23242 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms