Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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SftpcP21841 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SftpcP21841 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SftpcP21841 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SftpcP21841 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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