Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcb1aP21447 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms