Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BdnfP21237 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms