Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prph2P15499 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms