Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd44P15379 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd44P15379 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd44P15379 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd44P15379 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd44P15379 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd44P15379 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms