Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa1P11477 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms