Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fv4P11370 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fv4P11370 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms