Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolP11369 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolP11369 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolP11369 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolP11369 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolP11369 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolP11369 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolP11369 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP11369 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP11369 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP11369 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP11369 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP11369 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP11369 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP11369 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP11369 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP11369 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP11369 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP11369 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP11369 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP11369 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP11369 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP11369 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP11369 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP11369 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP11369 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms