Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CatspereP0DP43 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms