Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Igsf6P0C6B7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms