Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefmP08553 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefmP08553 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefmP08553 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefmP08553 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefmP08553 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefmP08553 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NefmP08553 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefmP08553 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefmP08553 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefmP08553 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefmP08553 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefmP08553 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefmP08553 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefmP08553 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NefmP08553 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NefmP08553 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefmP08553 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefmP08553 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefmP08553 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefmP08553 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefmP08553 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefmP08553 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefmP08553 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NefmP08553 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefmP08553 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefmP08553 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefmP08553 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NefmP08553 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NefmP08553 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefmP08553 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefmP08553 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefmP08553 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefmP08553 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefmP08553 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefmP08553 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefmP08553 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefmP08553 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NefmP08553 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefmP08553 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefmP08553 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefmP08553 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefmP08553 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NefmP08553 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefmP08553 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NefmP08553 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefmP08553 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefmP08553 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefmP08553 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefmP08553 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefmP08553 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefmP08553 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefmP08553 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NefmP08553 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefmP08553 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefmP08553 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefmP08553 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NefmP08553 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefmP08553 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefmP08553 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefmP08553 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefmP08553 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefmP08553 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefmP08553 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefmP08553 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefmP08553 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefmP08553 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NefmP08553 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms