Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-T23P06339 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-T23P06339 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms