Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06324 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06324 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06324 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06324 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06324 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06324 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06324 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06324 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06324 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06324 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06324 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06324 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06324 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06324 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06324 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P06324 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06324 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06324 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06324 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06324 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06324 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06324 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06324 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06324 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06324 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06324 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06324 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06324 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06324 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06324 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06324 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06324 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06324 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06324 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06324 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06324 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06324 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06324 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms