Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01678 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01678 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01678 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01678 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01678 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01678 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01678 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01678 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01678 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01678 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01678 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01678 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01678 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01678 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01678 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01678 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01678 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01678 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01678 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms