Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01641 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01641 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01641 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01641 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01641 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01641 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01641 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01641 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01641 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01641 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01641 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01641 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01641 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01641 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01641 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01641 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01641 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01641 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01641 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01641 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01641 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01641 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01641 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01641 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01641 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01641 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01641 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01641 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01641 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01641 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01641 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
P01641 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
P01641 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
P01641 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms