Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms