Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms