Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma3O70435 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psma3O70435 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma3O70435 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms