Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alx3O70137 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alx3O70137 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alx3O70137 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms