Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms