Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SlkO54988 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SlkO54988 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SlkO54988 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SlkO54988 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SlkO54988 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SlkO54988 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SlkO54988 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SlkO54988 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SlkO54988 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SlkO54988 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SlkO54988 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SlkO54988 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SlkO54988 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SlkO54988 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SlkO54988 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SlkO54988 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SlkO54988 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SlkO54988 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SlkO54988 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SlkO54988 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SlkO54988 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms