Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LatO54957 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LatO54957 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LatO54957 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LatO54957 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LatO54957 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LatO54957 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LatO54957 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LatO54957 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LatO54957 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LatO54957 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LatO54957 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LatO54957 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LatO54957 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LatO54957 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LatO54957 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LatO54957 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LatO54957 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LatO54957 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LatO54957 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LatO54957 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LatO54957 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LatO54957 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms