Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pole2O54956 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms