Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sp100O35892 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sp100O35892 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sp100O35892 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sp100O35892 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sp100O35892 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sp100O35892 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sp100O35892 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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