Protein–RNA interactions for Protein: O35701

Matn3, Matrilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn3O35701 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Matn3O35701 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms