Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KeraO35367 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KeraO35367 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KeraO35367 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KeraO35367 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KeraO35367 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KeraO35367 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KeraO35367 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KeraO35367 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KeraO35367 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KeraO35367 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KeraO35367 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KeraO35367 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KeraO35367 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KeraO35367 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KeraO35367 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms