Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna6O35345 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms