Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms