Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd4O35226 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms