Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Bhlhe40O35185 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms