Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms