Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efna5O08543 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efna5O08543 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna5O08543 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna5O08543 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms