Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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