Protein–RNA interactions for Protein: K7N6B6

Vmn1r168, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r168K7N6B6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r168K7N6B6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r168K7N6B6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms