Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm8261-201ENSMUST00000119275 1208 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms