Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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