Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
7530416G11RikJ3QJX6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms