Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm20828J3KMI7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20828J3KMI7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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