Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vmn1r34G3XA52 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vmn1r34G3XA52 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Vmn1r34G3XA52 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Vmn1r34G3XA52 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r34G3XA52 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Vmn1r34G3XA52 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Vmn1r34G3XA52 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vmn1r34G3XA52 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Vmn1r34G3XA52 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r34G3XA52 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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