Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim15G3UY57 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms