Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r39G3UWE6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms