Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cldn34aG3UW52 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms