Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20517G3UVU6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms