Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M1F7CXU4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms