Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm28038F7BCN9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Gm28038F7BCN9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm28038F7BCN9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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